t-viSNE/Data_Cortex_Nuclear.csv at 795eccadb1d92439217d24a495851ae666a77035 - t-viSNE - ISOVIS Group Git Repository

t-viSNE: Interactive Assessment and Interpretation of t-SNE Projections https://doi.org/10.1109/TVCG.2020.2986996

14 KiB

Raw Blame History

1	MouseID	DYRK1A_N	ITSN1_N	BDNF_N	NR1_N	NR2A_N	pAKT_N	pBRAF_N	pCAMKII_N	pCREB_N	pELK_N	pERK_N	pJNK_N	PKCA_N	pMEK_N	pNR1_N	pNR2A_N	pNR2B_N	pPKCAB_N	pRSK_N	AKT_N	BRAF_N	CAMKII_N	CREB_N	ELK_N	ERK_N	GSK3B_N	JNK_N	MEK_N	TRKA_N	RSK_N	APP_N	Bcatenin_N	SOD1_N	MTOR_N	P38_N	pMTOR_N	DSCR1_N	AMPKA_N	NR2B_N	pNUMB_N	RAPTOR_N	TIAM1_N	pP70S6_N	NUMB_N	P70S6_N	pGSK3B_N	pPKCG_N	CDK5_N	S6_N	ADARB1_N	AcetylH3K9_N	RRP1_N	BAX_N	ARC_N	ERBB4_N	nNOS_N	Tau_N	GFAP_N	GluR3_N	GluR4_N	IL1B_N	P3525_N	pCASP9_N	PSD95_N	SNCA_N	Ubiquitin_N	pGSK3B_Tyr216_N	SHH_N	BAD_N	BCL2_N	pS6_N	pCFOS_N	SYP_N	H3AcK18_N	EGR1_N	H3MeK4_N	CaNA_N	Genotype	Treatment	Behavior	class*
2	309_1	0.503643884	0.747193224	0.4301753	2.81632854	5.990151664	0.218830018	0.177565491	2.373744337	0.232223754	1.750935592	0.687906244	0.306381721	0.402698444	0.296927319	1.022060272	0.605672641	1.877683671	2.308745322	0.44159937	0.859365767	0.416289147	0.369608036	0.178944258	1.866358085	3.685247193	1.537226709	0.264526295	0.319676975	0.813866457	0.165845972	0.453909789	3.037620642	0.369509553	0.458538507	0.335335828	0.825192043	0.576915501	0.448099271	0.58627142	0.394721292	0.339570613	0.482863896	0.294169785	0.182150472	0.84272515	0.192608387	1.443090669	0.29469997	0.354604528	1.339069956	0.170118794	0.159102447	0.18885166	0.106305209	0.144989339	0.176667682	0.125190375	0.115290892	0.228043456	0.14275561	0.430957458	0.247537821	1.603309981	2.014874607	0.108234339	1.044979186	0.831556503	0.18885166	0.122652046		0.106305209	0.108335872	0.427099198	0.114783227	0.131790029	0.128185603	1.67565235	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
3	309_2	0.51461708	0.689063548	0.411770344	2.789514042	5.685037861	0.211636155	0.172817023	2.292149909	0.226972108	1.596376881	0.69500623	0.299051088	0.385986773	0.281318892	0.956675932	0.587558708	1.725773986	2.043036519	0.445221892	0.834659254	0.400364229	0.356177514	0.17367967	1.761046679	3.48528707	1.509249497	0.25572702	0.304418672	0.780504169	0.157193521	0.430940286	2.921882488	0.342279306	0.423559858	0.324834659	0.761717627	0.545097287	0.420876066	0.545097287	0.368254577	0.321959168	0.454519314	0.276430557	0.182086309	0.847614612	0.194815275	1.439459795	0.294059816	0.354548277	1.306323088	0.171427093	0.158128945	0.184570009	0.106592156	0.150470868	0.178309014	0.13427507	0.118234503	0.238073062	0.142036635	0.457156163	0.257632205	1.671737556	2.004605195	0.109748525	1.009883059	0.849270413	0.200403601	0.11668219		0.106592156	0.10431543	0.441581289	0.111973507	0.13510297	0.1311187	1.743609645	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
4	309_3	0.509183088	0.730246795	0.418308781	2.687201071	5.622058542	0.209010905	0.175722212	2.283336522	0.230246795	1.561316243	0.677348383	0.291276067	0.381002487	0.28171035	1.003634972	0.602448823	1.731872967	2.017983547	0.467667878	0.814329443	0.399846949	0.36808877	0.173904725	1.765544289	3.571455902	1.501243543	0.259613545	0.3117467	0.785154008	0.160895351	0.423187297	2.944136216	0.343696193	0.425004783	0.324851731	0.757030802	0.543619667	0.404629807	0.552994069	0.363879855	0.3130859	0.447197245	0.256648173	0.18438769	0.856165847	0.200737337	1.52436418	0.301880744	0.386086771	1.279600342	0.185456294	0.148696303	0.190532165	0.108303056	0.145330199	0.176212866	0.132560376	0.117760205	0.244817269	0.142444967	0.510472323	0.255343022	1.663549904	2.016830519	0.108196196	0.996847617	0.846708698	0.193684548	0.118508228		0.108303056	0.106219278	0.435776875	0.111882881	0.133361829	0.127431075	1.926426587	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
5	309_4	0.442106692	0.61707615	0.358626307	2.466947197	4.97950319	0.222885842	0.176462604	2.152300801	0.207004208	1.595086195	0.583276775	0.296728655	0.37708701	0.313831953	0.875390254	0.520293199	1.566852179	2.132754174	0.477670694	0.727704629	0.385638659	0.362970001	0.179448894	1.286276639	2.970137098	1.419709515	0.259535768	0.279218135	0.734491652	0.162209855	0.410614904	2.500203611	0.344509298	0.429211348	0.330120809	0.746979775	0.54676259	0.386860323	0.547848514	0.366770734	0.328491923	0.442649654	0.398534003	0.161767701	0.760233521	0.184169439	1.612382051	0.29638178	0.290679519	1.19876451	0.159799063	0.16611228	0.185323468	0.103183762	0.14065576	0.163804222	0.123209558	0.117439413	0.234946711	0.145068223	0.430995859	0.251103116	1.484624262	1.957233046	0.119883239	0.990224696	0.833276763	0.192111873	0.13278121		0.103183762	0.111261965	0.391690992	0.130405268	0.147444165	0.146901093	1.700563438	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
6	309_5	0.434940244	0.617429838	0.358802202	2.36578488	4.718678663	0.213105949	0.173626964	2.134013697	0.192157916	1.504229891	0.550960118	0.286961192	0.363502081	0.277964281	0.864912045	0.507989795	1.480059084	2.013696791	0.483416141	0.687793742	0.367530549	0.355310863	0.174835504	1.324694508	2.896334094	1.35987646	0.250704982	0.273667249	0.702699073	0.154827447	0.398549752	2.456559688	0.329125822	0.408755203	0.313414798	0.691956493	0.536860481	0.360816436	0.512823956	0.35155096	0.312206258	0.419094938	0.393447026	0.16020025	0.768112919	0.185718259	1.645807259	0.29682937	0.309345015	1.206994855	0.164650257	0.16068697	0.188221388	0.104783757	0.141983034	0.167709637	0.136837714	0.116047838	0.255527743	0.140870533	0.481226533	0.25177305	1.534835211	2.009108608	0.119524406	0.997774997	0.878667779	0.205604228	0.129954109		0.104783757	0.110693923	0.434153803	0.118481435	0.140314282	0.148379919	1.839730218	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
7	309_6	0.447506385	0.62817583	0.36738809	2.38593897	4.807635435	0.218577766	0.176233365	2.14128243	0.195187525	1.442398172	0.566339562	0.289823901	0.363892996	0.26683694	0.85912085	0.521306627	1.538244388	1.968275306	0.495899987	0.672402205	0.36940449	0.357171663	0.179728458	1.227449926	2.956983466	1.447909665	0.250840167	0.284043554	0.704395752	0.156875924	0.391047184	2.467132679	0.327597795	0.404489851	0.296276381	0.674418605	0.539723081	0.354214276	0.51431644	0.347224089	0.303132141	0.412824304	0.382578304	0.162330317	0.77969457	0.186792986	1.634615385	0.28803733	0.332367081	1.12344457	0.175692873	0.150593891	0.183823529	0.106476244	0.13956448	0.174844457	0.130514706	0.115243213	0.236849548	0.13645362	0.478577489	0.244485294	1.507777149	2.003535068	0.120687217	0.920178167	0.843679299	0.190469457	0.131575226		0.106476244	0.109445701	0.439833145	0.11665724	0.140766403	0.14218043	1.816388575	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
8	309_7	0.428032684	0.573695789	0.342708988	2.334223759	4.473130107	0.225172847	0.184003771	2.012413576	0.195788812	1.612036455	0.509899434	0.299654305	0.37115022	0.277655563	0.844280327	0.485386549	1.494814582	2.01257071	0.497485858	0.646134507	0.395977373	0.359522313	0.186046512	1.10779384	2.599622879	1.364236329	0.261470773	0.276241358	0.693117536	0.162162162	0.405562539	2.288812068	0.345380264	0.427561282	0.333909491	0.757542426	0.558610937	0.368950346	0.544626021	0.360307982	0.329352608	0.420490258	0.465116279	0.145565999	0.70224765	0.177033102	1.773845525	0.292194524	0.266857376	1.03228443	0.147854516	0.149816101	0.181610135	0.097834083	0.142787086	0.15185942	0.115978749	0.114752758	0.22451982	0.144830405	0.415529219	0.238005721	1.338782182	1.861708214	0.117041275	1.028769922	0.798283613	0.181610135	0.141806293		0.097834083	0.111483449	0.406293421	0.13722926	0.156681651	0.157498978	1.528483858	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
9	309_8	0.416922604	0.564035627	0.327702703	2.260135135	4.268734644	0.214834152	0.179668305	2.007985258	0.18980344	1.424600737	0.501074939	0.283015971	0.358875921	0.256449631	0.818642506	0.478501229	1.409398034	1.85703317	0.48955774	0.628071253	0.360718673	0.360718673	0.171836609	1.077395577	2.550214988	1.316646192	0.250614251	0.265356265	0.676597052	0.159551597	0.375460688	2.281173219	0.328163391	0.407248157	0.322788698	0.695178133	0.525030713	0.340141278	0.50982801	0.338298526	0.298525799	0.39296683	0.44041769	0.147848101	0.681940928	0.174599156	1.795780591	0.288523207	0.288607595	1.152067511	0.152405063	0.154514768	0.182869198	0.099493671	0.140168776	0.158734177	0.119578059	0.116202532	0.246835443	0.13443038	0.451139241	0.241434599	1.386075949	1.969451477	0.116877637	0.943544304	0.843966245	0.191561181	0.141012658		0.099493671	0.113080169	0.382531646	0.123375527	0.155611814	0.159409283	1.652658228	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
10	309_9	0.386310905	0.538428074	0.317720418	2.125725058	4.063950116	0.207221578	0.167778422	1.861513921	0.180684455	1.261890951	0.476653132	0.266966357	0.337006961	0.242604408	0.748259861	0.458961717	1.341792343	1.822070766	0.464472158	0.600638051	0.326566125	0.328886311	0.170388631	1.008845708	2.434599768	1.252030162	0.230423434	0.252610209	0.635585847	0.154147332	0.351218097	2.139211137	0.309164733	0.378480278	0.294518561	0.636890951	0.484918794	0.32337587	0.479988399	0.312064965	0.279292343	0.357598608	0.421693735	0.150120856	0.710808011	0.167472376	1.805248619	0.294457873	0.294112569	1.107907459	0.158839779	0.148653315	0.178522099	0.105145028	0.137776243	0.160393646	0.123964088	0.116799033	0.233857044	0.132596685	0.455973757	0.236015193	1.404178177	1.958736188	0.11386395	0.94690953	0.83218232	0.186377762	0.139589088		0.105145028	0.105490331	0.435687155	0.125172652	0.152710635	0.158235497	1.834599448	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
11	309_10	0.380827447	0.499293643	0.362462159	2.096266398	3.598587286	0.22764884	0.188092836	1.717860747	0.188092836	1.414328961	0.455499495	0.324117053	0.368314834	0.283753784	0.743491423	0.44419778	1.355398587	1.783249243	0.493037336	0.570534813	0.335418769	0.392129162	0.198385469	0.906155399	2.169929364	1.248234107	0.257719475	0.301513623	0.636730575	0.174369324	0.380423814	1.922906155	0.373965691	0.433501514	0.394349142	0.742078708	0.553178607	0.357214934	0.530978809	0.358627649	0.336024218	0.426034309	0.505751766	0.14006295	0.637927158	0.175584532	1.926596223	0.301821043	0.24977518	0.930980216	0.145458633	0.166254496	0.171088129	0.09330036	0.12443795	0.150629496	0.117580935	0.126573741	0.224145683	0.148156475	0.410971223	0.244829137	1.288669065	1.818907374	0.13995054	0.970323741	0.803394784	0.189523381	0.183678058		0.09330036	0.116906475	0.414793165	0.146133094	0.188848921	0.192333633	1.516861511	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
12	309_11	0.366511251	0.513277924	0.327792418	2.072572471	3.66105818	0.229474965	0.193796878	1.724508413	0.185282789	1.31867018	0.461179809	0.290289884	0.3794851	0.271234543	0.765659842	0.449422258	1.297993108	1.756132171	0.509831745	0.547536996	0.346036894	0.362659639	0.196229475	0.891952159	2.171903507	1.231096696	0.266166633	0.262720454	0.635313197	0.169673627	0.418812082	1.957834989	0.34684776	0.428137036	0.352118386	0.693087371	0.54672613	0.343807014	0.524021893	0.341374417	0.323535374	0.406649098	0.513277924	0.144505369	0.662097327	0.173292209	1.902901531	0.298377884	0.275416952	0.899017592	0.144391135	0.169979438	0.183801691	0.094356865	0.128169979	0.149988577	0.125999543	0.119716701	0.235549463	0.134110121	0.429403701	0.250628284	1.326707791	1.861549006	0.126799178	0.940370117	0.842472013	0.190769934	0.168037469		0.094356865	0.131254284	0.385423806	0.151816313	0.184601325	0.193054604	1.613548092	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
13	309_12	0.364153907	0.499411072	0.355123675	2.006870828	3.466627405	0.216332941	0.204358068	1.672555948	0.190223793	1.166077739	0.447192776	0.27718885	0.361405575	0.26442874	0.743031017	0.443855516	1.250098155	1.690812721	0.492343934	0.549862583	0.323125245	0.344719278	0.197879859	0.862583431	2.108755399	1.20691009	0.243423636	0.281311347	0.615822536	0.160581076	0.368080094	1.887711033	0.333922261	0.408912446	0.33451119	0.666274048	0.529053789	0.326266196	0.505300353	0.330977621	0.319199058	0.384766392	0.501570475	0.142299503	0.675065058	0.180151408	2.001656021	0.306837	0.287319612	0.967707594	0.159451147	0.15554767	0.17411876	0.098414952	0.135557133	0.160752307	0.127986752	0.115448308	0.236337828	0.141116631	0.455050863	0.249704282	1.30305181	1.913532056	0.124201561	0.911521173	0.836172226	0.194819021	0.166311805		0.098414952	0.125266146	0.442394133	0.149988171	0.191861841	0.195528744	1.722971374	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
14	309_13	0.364873351	0.482101737	0.312539251	1.946200544	3.349591794	0.230898053	0.188821436	1.508687461	0.171027842	1.353359849	0.471844254	0.272137325	0.340590329	0.256018422	0.723047938	0.417416789	1.226711325	1.737701486	0.461168097	0.494871258	0.384969646	0.339543647	0.199288256	0.869583421	1.925685577	1.149047519	0.273812016	0.256018422	0.612727653	0.16474775	0.366338706	1.749214988	0.322378062	0.426418254	0.37366548	0.690391459	0.528155746	0.353150513	0.520619636	0.32593678	0.332426209	0.466610844	0.464098807	0.12679558	0.589502762	0.167403315	1.904005525	0.279696133	0.244889503	0.944060773	0.137845304	0.176381215	0.175276243	0.097651934	0.123756906	0.15	0.117403315	0.126657459	0.223480663	0.14198895	0.395441989	0.277624309	1.251933702	1.760635359	0.160773481	0.997237569	0.80980663	0.203314917	0.200276243		0.097651934	0.126933702	0.440331492	0.168370166	0.236878453	0.214088398	1.426933702	Control	Memantine	C/S	c-CS-m
15	309_14	0.381910612	0.485914001	0.31095107	1.958907011	3.349290405	0.225799619	0.188519381	1.50900233	0.179834781	1.219656852	0.463249312	0.284261809	0.36030502	0.262868036	0.755348443	0.41897903	1.197203982	1.686083457	0.485066723	0.524465156	0.343359458	0.347172209	0.214573184	0.814022453	1.956576996	1.137894514	0.239779708	0.25672527	0.579114594	0.164371955	0.367295065	1.770599449	0.339970345	0.427028172	0.370684177	0.68904893	0.524041517	0.337216691	0.4956577	0.329379369	0.321965685	0.403728024	0.462825673	0.134298973	0.611165799	0.170862045	1.972577697	0.283785684	0.254957109	0.929545774	0.136408381	0.172971453	0.174377725	0.094642104	0.142314724	0.154408663	0.117283083	0.123892561	0.24483195	0.136127127	0.415412741	0.252003938	1.288707636	1.792434257	0.131345802	0.980874701	0.832794262	0.190127971	0.196034313		0.094642104	0.125017578	0.422162846	0.178737168	0.215581493	0.22528477	1.500070314	Control	Memantine	C/S	c-CS-m